Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP3P08254 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP3P08254 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP3P08254 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP3P08254 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP3P08254 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP3P08254 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP3P08254 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP3P08254 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP3P08254 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP3P08254 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP3P08254 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP3P08254 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP3P08254 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP3P08254 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP3P08254 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP3P08254 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP3P08254 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP3P08254 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP3P08254 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP3P08254 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP3P08254 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP3P08254 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP3P08254 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP3P08254 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP3P08254 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP3P08254 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP3P08254 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP3P08254 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP3P08254 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP3P08254 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP3P08254 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP3P08254 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP3P08254 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP3P08254 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP3P08254 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP3P08254 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP3P08254 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP3P08254 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP3P08254 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP3P08254 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP3P08254 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP3P08254 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP3P08254 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP3P08254 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP3P08254 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP3P08254 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP3P08254 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP3P08254 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP3P08254 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP3P08254 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP3P08254 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP3P08254 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP3P08254 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP3P08254 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP3P08254 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP3P08254 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP3P08254 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP3P08254 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP3P08254 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP3P08254 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP3P08254 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP3P08254 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP3P08254 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP3P08254 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP3P08254 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP3P08254 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP3P08254 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP3P08254 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP3P08254 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP3P08254 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP3P08254 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP3P08254 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP3P08254 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP3P08254 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP3P08254 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP3P08254 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP3P08254 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP3P08254 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP3P08254 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP3P08254 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP3P08254 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP3P08254 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP3P08254 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP3P08254 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP3P08254 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP3P08254 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP3P08254 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP3P08254 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP3P08254 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP3P08254 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP3P08254 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP3P08254 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP3P08254 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP3P08254 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP3P08254 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP3P08254 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP3P08254 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP3P08254 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MMP3P08254 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms