Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK1P06493 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK1P06493 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK1P06493 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK1P06493 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK1P06493 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK1P06493 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK1P06493 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK1P06493 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK1P06493 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK1P06493 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK1P06493 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK1P06493 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK1P06493 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK1P06493 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK1P06493 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK1P06493 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK1P06493 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK1P06493 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK1P06493 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK1P06493 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK1P06493 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK1P06493 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK1P06493 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK1P06493 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK1P06493 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK1P06493 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK1P06493 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK1P06493 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK1P06493 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK1P06493 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK1P06493 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK1P06493 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK1P06493 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK1P06493 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK1P06493 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK1P06493 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK1P06493 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK1P06493 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK1P06493 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK1P06493 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK1P06493 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK1P06493 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK1P06493 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK1P06493 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK1P06493 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK1P06493 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK1P06493 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK1P06493 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK1P06493 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK1P06493 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK1P06493 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK1P06493 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK1P06493 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK1P06493 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK1P06493 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK1P06493 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK1P06493 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK1P06493 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK1P06493 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK1P06493 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK1P06493 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK1P06493 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK1P06493 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK1P06493 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK1P06493 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK1P06493 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK1P06493 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK1P06493 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK1P06493 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK1P06493 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK1P06493 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK1P06493 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK1P06493 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK1P06493 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK1P06493 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK1P06493 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK1P06493 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK1P06493 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK1P06493 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK1P06493 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK1P06493 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK1P06493 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK1P06493 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK1P06493 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK1P06493 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK1P06493 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK1P06493 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK1P06493 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK1P06493 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK1P06493 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK1P06493 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK1P06493 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK1P06493 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK1P06493 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK1P06493 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK1P06493 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK1P06493 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK1P06493 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK1P06493 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms