Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NUPL2O15504 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms