Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
POLR1CO15160 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
POLR1CO15160 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms