Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PSDA5PKW4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSDA5PKW4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSDA5PKW4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms