Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TMEM89A2RUT3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM89A2RUT3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms