Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAPPC1Q9Y5R8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRAPPC1Q9Y5R8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms