Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PAXBP1Q9Y5B6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms