Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
INO80Q9ULG1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
INO80Q9ULG1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
INO80Q9ULG1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
INO80Q9ULG1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
INO80Q9ULG1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
INO80Q9ULG1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
INO80Q9ULG1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
INO80Q9ULG1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
INO80Q9ULG1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
INO80Q9ULG1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
INO80Q9ULG1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
INO80Q9ULG1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
INO80Q9ULG1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
INO80Q9ULG1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
INO80Q9ULG1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
INO80Q9ULG1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
INO80Q9ULG1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
INO80Q9ULG1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms