Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF2IRD1Q9UHL9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms