Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.52■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
USP35Q9P2H5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP35Q9P2H5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
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