Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPTLC3Q9NUV7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTLC3Q9NUV7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms