Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRKRIP1Q9H875 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKRIP1Q9H875 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms