Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPR88Q9GZN0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPR88Q9GZN0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms