Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRSF8Q9BRL6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms