Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SVOPQ8N4V2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SVOPQ8N4V2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms