Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RBBP6Q7Z6E9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RBBP6Q7Z6E9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms