Protein–RNA interactions for Protein: Q6L9W6

B4GALNT3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
B4GALNT3Q6L9W6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
B4GALNT3Q6L9W6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
B4GALNT3Q6L9W6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
B4GALNT3Q6L9W6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
B4GALNT3Q6L9W6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
B4GALNT3Q6L9W6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
B4GALNT3Q6L9W6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
B4GALNT3Q6L9W6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
B4GALNT3Q6L9W6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
B4GALNT3Q6L9W6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
B4GALNT3Q6L9W6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
B4GALNT3Q6L9W6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
B4GALNT3Q6L9W6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms