Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COBLL1Q53SF7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COBLL1Q53SF7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms