Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SF3A2Q15428 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms