Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 SPPL2B-213ENST00000621568 1017 ntTSL 519.79■□□□□ 0.769e-7■■■■□ 20
PCBP1Q15365 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.769e-7■■■■□ 20
PCBP1Q15365 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.132e-10■■■■□ 20
PCBP1Q15365 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.242e-10■■■■□ 20
PCBP1Q15365 CSK-213ENST00000569462 534 ntTSL 420.91■□□□□ 0.942e-18■■■■□ 20
PCBP1Q15365 CSK-208ENST00000567123 556 ntTSL 416.96■□□□□ 0.312e-18■■■■□ 20
PCBP1Q15365 HMGXB4-201ENST00000216106 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.074e-10■■■■□ 20
PCBP1Q15365 HMGXB4-202ENST00000418170 4216 ntTSL 1 (best)7.65□□□□□ -1.184e-10■■■■□ 20
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PCBP1Q15365 GNAS-243ENST00000484504 662 ntTSL 231.01■■■□□ 2.551e-36■■■■□ 20
PCBP1Q15365 GNAS-235ENST00000478585 543 ntTSL 229.25■■■□□ 2.271e-36■■■■□ 20
PCBP1Q15365 GNAS-257ENST00000604005 693 ntTSL 329.25■■■□□ 2.271e-36■■■■□ 20
PCBP1Q15365 GNAS-228ENST00000469431 702 ntTSL 529.25■■■□□ 2.271e-36■■■■□ 20
PCBP1Q15365 GNAS-229ENST00000470512 913 ntTSL 527.97■■■□□ 2.071e-36■■■■□ 20
PCBP1Q15365 GNAS-224ENST00000464960 986 ntTSL 227.82■■■□□ 2.041e-36■■■■□ 20
PCBP1Q15365 GNAS-237ENST00000480232 893 ntTSL 527.75■■■□□ 2.031e-36■■■■□ 20
PCBP1Q15365 GNAS-234ENST00000477931 1663 ntTSL 1 (best)25.95■■□□□ 1.741e-36■■■■□ 20
PCBP1Q15365 GNAS-238ENST00000480975 1534 ntTSL 521.75■■□□□ 1.071e-36■■■■□ 20
PCBP1Q15365 GNAS-226ENST00000467321 733 ntTSL 521.06■□□□□ 0.961e-36■■■■□ 20
PCBP1Q15365 GNAS-240ENST00000481768 1903 ntTSL 1 (best)20.51■□□□□ 0.871e-36■■■■□ 20
PCBP1Q15365 GNAS-220ENST00000461152 278 ntTSL 520.44■□□□□ 0.861e-36■■■■□ 20
PCBP1Q15365 GNAS-250ENST00000491348 1068 ntTSL 320.1■□□□□ 0.811e-36■■■■□ 20
PCBP1Q15365 GNAS-230ENST00000472183 911 ntTSL 320.1■□□□□ 0.811e-36■■■■□ 20
PCBP1Q15365 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.441e-36■■■■□ 20
PCBP1Q15365 GNAS-223ENST00000464788 583 ntTSL 217.66■□□□□ 0.421e-36■■■■□ 20
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PCBP1Q15365 GNAS-221ENST00000462499 492 ntTSL 215.83■□□□□ 0.121e-36■■■■□ 20
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PCBP1Q15365 GNAS-219ENST00000453292 632 ntTSL 514.48□□□□□ -0.091e-36■■■■□ 20
PCBP1Q15365 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.21e-36■■■■□ 20
PCBP1Q15365 GNAS-222ENST00000464624 3764 ntTSL 513.73□□□□□ -0.211e-36■■■■□ 20
PCBP1Q15365 GNAS-252ENST00000493744 812 ntTSL 213.22□□□□□ -0.291e-36■■■■□ 20
PCBP1Q15365 GNAS-239ENST00000481039 756 ntTSL 512.51□□□□□ -0.411e-36■■■■□ 20
PCBP1Q15365 GNAS-217ENST00000423897 736 ntTSL 312.47□□□□□ -0.411e-36■■■■□ 20
PCBP1Q15365 GNAS-247ENST00000488546 897 ntTSL 512.25□□□□□ -0.451e-36■■■■□ 20
PCBP1Q15365 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.481e-36■■■■□ 20
PCBP1Q15365 GNAS-216ENST00000419558 729 ntTSL 311.97□□□□□ -0.491e-36■■■■□ 20
PCBP1Q15365 GNAS-208ENST00000371075 2551 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.691e-36■■■■□ 20
PCBP1Q15365 GNAS-204ENST00000313949 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.781e-36■■■■□ 20
PCBP1Q15365 GNAS-218ENST00000450130 595 ntTSL 510.03□□□□□ -0.81e-36■■■■□ 20
PCBP1Q15365 GNAS-227ENST00000468895 583 ntTSL 39.2□□□□□ -0.941e-36■■■■□ 20
PCBP1Q15365 GNAS-225ENST00000467227 543 ntTSL 38.86□□□□□ -0.991e-36■■■■□ 20
PCBP1Q15365 SREBF1-206ENST00000423161 1058 ntTSL 320.57■□□□□ 0.887e-11■■■■□ 19.9
PCBP1Q15365 SREBF1-211ENST00000476994 591 ntTSL 219.31■□□□□ 0.689e-11■■■■□ 19.9
PCBP1Q15365 SREBF1-222ENST00000583732 580 ntTSL 416.81■□□□□ 0.287e-11■■■■□ 19.9
PCBP1Q15365 SREBF1-217ENST00000577897 536 ntTSL 414.9□□□□□ -0.027e-11■■■■□ 19.9
PCBP1Q15365 FARP1-231ENST00000600648 433 ntTSL 523.93■■□□□ 1.427e-7■■■■□ 19.9
PCBP1Q15365 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.417e-7■■■■□ 19.9
PCBP1Q15365 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.117e-7■■■■□ 19.9
PCBP1Q15365 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.752e-16■■■■□ 19.9
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PCBP1Q15365 ALDOC-203ENST00000395321 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.372e-16■■■■□ 19.9
PCBP1Q15365 ERF-206ENST00000596818 566 ntTSL 317.98■□□□□ 0.472e-7■■■■□ 19.9
PCBP1Q15365 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.436e-9■■■■□ 19.9
PCBP1Q15365 SPRED2-201ENST00000356388 4097 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.361e-14■■■■□ 19.9
PCBP1Q15365 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.052e-7■■■■□ 19.9
PCBP1Q15365 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.762e-15■■■■□ 19.9
PCBP1Q15365 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.712e-15■■■■□ 19.9
PCBP1Q15365 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.691e-6■■■■□ 19.9
PCBP1Q15365 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.631e-6■■■■□ 19.9
PCBP1Q15365 CXXC1-205ENST00000586502 541 ntTSL 318.36■□□□□ 0.531e-6■■■■□ 19.9
PCBP1Q15365 CXXC1-209ENST00000587342 802 ntTSL 217.85■□□□□ 0.451e-6■■■■□ 19.9
PCBP1Q15365 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.311e-6■■■■□ 19.9
PCBP1Q15365 CXXC1-203ENST00000586144 474 ntTSL 216.42■□□□□ 0.221e-6■■■■□ 19.9
PCBP1Q15365 CXXC1-206ENST00000586568 866 ntTSL 216.4■□□□□ 0.221e-6■■■■□ 19.9
PCBP1Q15365 CXXC1-214ENST00000590901 2562 ntTSL 215.91■□□□□ 0.141e-6■■■■□ 19.9
PCBP1Q15365 CXXC1-208ENST00000587170 476 ntTSL 215.81■□□□□ 0.121e-6■■■■□ 19.9
PCBP1Q15365 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.241e-18■■■■□ 19.8
PCBP1Q15365 HNF1A-AS1-202ENST00000535301 536 ntTSL 4 BASIC9.03□□□□□ -0.961e-7■■■■□ 19.8
PCBP1Q15365 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.41e-7■■■■□ 19.8
PCBP1Q15365 SREBF1-203ENST00000395751 4653 ntTSL 216.48■□□□□ 0.237e-10■■■■□ 19.8
PCBP1Q15365 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.137e-10■■■■□ 19.8
PCBP1Q15365 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.187e-10■■■■□ 19.8
PCBP1Q15365 SRRM2-218ENST00000574331 1759 ntTSL 218.92■□□□□ 0.622e-15■■■■□ 19.8
PCBP1Q15365 MAP2K5-212ENST00000560591 1457 ntTSL 36.24□□□□□ -1.416e-9■■■■□ 19.8
PCBP1Q15365 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.628e-10■■■■□ 19.8
PCBP1Q15365 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.628e-10■■■■□ 19.8
PCBP1Q15365 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.488e-10■■■■□ 19.8
PCBP1Q15365 AC011448.1-202ENST00000586674 1071 ntTSL 220.91■□□□□ 0.941e-13■■■■□ 19.8
PCBP1Q15365 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.758e-10■■■■□ 19.8
PCBP1Q15365 SKI-202ENST00000478223 294 ntTSL 312.92□□□□□ -0.348e-10■■■■□ 19.8
PCBP1Q15365 SKI-204ENST00000508416 252 ntTSL 311.66□□□□□ -0.548e-10■■■■□ 19.8
PCBP1Q15365 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.97e-7■■■■□ 19.8
PCBP1Q15365 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.341e-6■■■■□ 19.8
PCBP1Q15365 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.351e-6■■■■□ 19.8
PCBP1Q15365 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.341e-6■■■■□ 19.8
PCBP1Q15365 SERINC2-204ENST00000491976 2807 ntTSL 217.09■□□□□ 0.331e-6■■■■□ 19.8
PCBP1Q15365 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.141e-6■■■■□ 19.8
PCBP1Q15365 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.486e-7■■■■□ 19.8
PCBP1Q15365 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.176e-7■■■■□ 19.8
PCBP1Q15365 FDFT1-212ENST00000528643 1909 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.996e-12■■■■□ 19.8
PCBP1Q15365 RHOC-216ENST00000484280 891 ntTSL 514.49□□□□□ -0.092e-8■■■■□ 19.8
PCBP1Q15365 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.74e-10■■■■□ 19.8
PCBP1Q15365 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.534e-10■■■■□ 19.8
PCBP1Q15365 TTLL12-203ENST00000484711 2451 ntTSL 215.23■□□□□ 0.034e-10■■■■□ 19.8
PCBP1Q15365 ACTN4-208ENST00000497637 877 ntTSL 221.12■□□□□ 0.973e-7■■■■□ 19.8
PCBP1Q15365 ERF-207ENST00000598965 264 ntTSL 315.68■□□□□ 0.11e-9■■■■□ 19.8
PCBP1Q15365 MSN-201ENST00000360270 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -12e-9■■■■□ 19.8
PCBP1Q15365 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.135e-8■■■■□ 19.7
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