Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFIXQ14938 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIXQ14938 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIXQ14938 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIXQ14938 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIXQ14938 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIXQ14938 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIXQ14938 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIXQ14938 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIXQ14938 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIXQ14938 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIXQ14938 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIXQ14938 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIXQ14938 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFIXQ14938 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFIXQ14938 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFIXQ14938 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFIXQ14938 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
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