Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.034e-11■■■■□ 24.1
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PABPC4Q13310 MXD4-202ENST00000510822 561 ntTSL 320.21■□□□□ 0.834e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.554e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.524e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 MXD4-205ENST00000515378 522 ntTSL 218.12■□□□□ 0.494e-7■■■■□ 24.1
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PABPC4Q13310 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.264e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.114e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 LETMD1-222ENST00000550274 809 ntTSL 215.46■□□□□ 0.074e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -04e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.024e-7■■■■□ 24.1
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PABPC4Q13310 ZUFSP-202ENST00000368576 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.134e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.154e-9■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.164e-9■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 PTGS1-201ENST00000223423 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.184e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.194e-7■■■■□ 24.1
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PABPC4Q13310 UBE2D3-211ENST00000502404 574 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.224e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 IQGAP3-203ENST00000491900 5294 ntTSL 1 (best)13.38□□□□□ -0.274e-11■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 TBC1D14-201ENST00000409757 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.34e-7■■■■□ 24.1
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PABPC4Q13310 UBE2D3-206ENST00000357194 660 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.394e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 IQGAP3-201ENST00000361170 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.414e-11■■■■□ 24.1
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PABPC4Q13310 UBE2D3-205ENST00000350435 711 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.554e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 PTGS1-202ENST00000362012 4964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.564e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 UBE2D3-202ENST00000338145 896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.564e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 TBC1D14-207ENST00000448507 4887 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.584e-7■■■■□ 24.1
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PABPC4Q13310 PTGS1-207ENST00000619306 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.624e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 LETMD1-228ENST00000550929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.654e-7■■■■□ 24.1
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PABPC4Q13310 TBC1D14-206ENST00000446947 4021 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.734e-7■■■■□ 24.1
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PABPC4Q13310 C7orf49-204ENST00000459937 2576 ntTSL 1 (best)8.97□□□□□ -0.974e-6■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 CWC15-201ENST00000279839 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.984e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.024e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 RRM2B-202ENST00000395910 800 ntTSL 28.57□□□□□ -1.044e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 LETMD1-236ENST00000553043 727 ntTSL 28.51□□□□□ -1.054e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 UBE2D3-204ENST00000349311 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.084e-7■■■■□ 24.1
PABPC4Q13310 TSPAN3-209ENST00000560715 2892 ntTSL 27.77□□□□□ -1.174e-7■■■■□ 24.1
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PABPC4Q13310 SLC25A24-203ENST00000565488 4271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.19e-8■■■■□ 24
PABPC4Q13310 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.159e-15■■■■□ 24
PABPC4Q13310 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.179e-15■■■■□ 24
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PABPC4Q13310 SLC25A24-202ENST00000370041 3404 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.039e-8■■■■□ 24
PABPC4Q13310 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.25e-52■■■■□ 24
PABPC4Q13310 H2AFY-215ENST00000510038 1314 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.535e-52■■■■□ 24
PABPC4Q13310 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.361e-6■■■■□ 24
PABPC4Q13310 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.752e-7■■■■□ 24
PABPC4Q13310 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.626e-9■■■■□ 24
PABPC4Q13310 C7orf50-204ENST00000412051 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 226.29■■□□□ 1.86e-9■■■■□ 24
PABPC4Q13310 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.286e-9■■■■□ 24
PABPC4Q13310 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.116e-9■■■■□ 24
PABPC4Q13310 APOBEC3C-201ENST00000361441 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.51e-7■■■■□ 24
PABPC4Q13310 AL022318.4-201ENST00000381568 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.521e-7■■■■□ 24
PABPC4Q13310 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.555e-8■■■■□ 24
PABPC4Q13310 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.735e-8■■■■□ 24
PABPC4Q13310 GALK1-209ENST00000592997 717 ntTSL 223.05■■□□□ 1.285e-8■■■■□ 24
PABPC4Q13310 GALK1-203ENST00000586733 465 ntTSL 220.95■□□□□ 0.945e-8■■■■□ 24
PABPC4Q13310 GALK1-207ENST00000589643 313 ntTSL 317.36■□□□□ 0.375e-8■■■■□ 24
PABPC4Q13310 PHPT1-204ENST00000463215 627 ntTSL 217.63■□□□□ 0.413e-7■■■■□ 24
PABPC4Q13310 TMEM18-207ENST00000477202 1767 ntTSL 224.52■■□□□ 1.523e-6■■■■□ 24
PABPC4Q13310 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.363e-6■■■■□ 24
PABPC4Q13310 TMEM18-208ENST00000497508 1706 ntTSL 216.86■□□□□ 0.293e-6■■■■□ 24
PABPC4Q13310 TMEM18-205ENST00000432667 2572 ntTSL 515.74■□□□□ 0.113e-6■■■■□ 24
PABPC4Q13310 TMEM18-203ENST00000405941 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.033e-6■■■■□ 24
PABPC4Q13310 TMEM18-202ENST00000355654 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.33e-6■■■■□ 24
PABPC4Q13310 TMEM18-201ENST00000281017 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.323e-6■■■■□ 24
PABPC4Q13310 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.769e-7■■■■□ 24
PABPC4Q13310 TRIR-204ENST00000591254 988 ntTSL 231.18■■■□□ 2.583e-7■■■■□ 24
PABPC4Q13310 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.213e-7■■■■□ 24
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