RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223423.8

PTGS1-201, Transcript of prostaglandin-endoperoxide synthase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGS1, Length 2,328 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1-201ENST00000223423 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.29■■□□□ 1.96
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PTGS1-201ENST00000223423 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
PTGS1-201ENST00000223423 ABCC9O60706 1549 aa22.83■■□□□ 1.25
PTGS1-201ENST00000223423 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.76■■□□□ 1.23
PTGS1-201ENST00000223423 DCAF8L2P0C7V8 631 aa22.56■■□□□ 1.2
PTGS1-201ENST00000223423 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.47■■□□□ 1.19
PTGS1-201ENST00000223423 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PTGS1-201ENST00000223423 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.01■■□□□ 1.11
PTGS1-201ENST00000223423 NACADO15069 1562 aa21.89■■□□□ 1.1
PTGS1-201ENST00000223423 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.87■■□□□ 1.09
PTGS1-201ENST00000223423 SCRIBQ14160 1630 aa21.81■■□□□ 1.08
PTGS1-201ENST00000223423 UNC13AQ9UPW8 1703 aa21.65■■□□□ 1.06
PTGS1-201ENST00000223423 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
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PTGS1-201ENST00000223423 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.35■■□□□ 1.01
PTGS1-201ENST00000223423 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.35■■□□□ 1.01
PTGS1-201ENST00000223423 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.27■■□□□ 1
PTGS1-201ENST00000223423 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.16■□□□□ 0.98
PTGS1-201ENST00000223423 WIZO95785 1651 aa21■□□□□ 0.95
PTGS1-201ENST00000223423 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
PTGS1-201ENST00000223423 SMARCA4P51532 1647 aa20.87■□□□□ 0.93
PTGS1-201ENST00000223423 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
PTGS1-201ENST00000223423 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
PTGS1-201ENST00000223423 TRIM41Q8WV44 630 aa20.67■□□□□ 0.9
PTGS1-201ENST00000223423 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.65■□□□□ 0.9
PTGS1-201ENST00000223423 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.63■□□□□ 0.89
PTGS1-201ENST00000223423 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.6■□□□□ 0.89
PTGS1-201ENST00000223423 SMARCA2P51531 1590 aa20.58■□□□□ 0.89
PTGS1-201ENST00000223423 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.57■□□□□ 0.88
PTGS1-201ENST00000223423 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.55■□□□□ 0.88
PTGS1-201ENST00000223423 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.45■□□□□ 0.86
PTGS1-201ENST00000223423 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
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PTGS1-201ENST00000223423 ABCC8Q09428 1581 aa20.34■□□□□ 0.85
PTGS1-201ENST00000223423 NCAPD3P42695 1498 aa20.24■□□□□ 0.83
PTGS1-201ENST00000223423 EHMT2Q96KQ7 1210 aa20.19■□□□□ 0.82
PTGS1-201ENST00000223423 HMGXB3Q12766 1538 aa20.15■□□□□ 0.82
PTGS1-201ENST00000223423 PCGF6Q9BYE7 350 aa20.12■□□□□ 0.81
PTGS1-201ENST00000223423 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
PTGS1-201ENST00000223423 SOGA1O94964 1423 aa20.07■□□□□ 0.8
PTGS1-201ENST00000223423 SYNJ1O43426 1573 aa20.02■□□□□ 0.8
PTGS1-201ENST00000223423 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.99■□□□□ 0.79
PTGS1-201ENST00000223423 EEA1Q15075 1411 aa19.96■□□□□ 0.79
PTGS1-201ENST00000223423 NESP48681 1621 aa19.94■□□□□ 0.78
PTGS1-201ENST00000223423 CSRNP3Q8WYN3 585 aa19.92■□□□□ 0.78
PTGS1-201ENST00000223423 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
PTGS1-201ENST00000223423 CFTRP13569 1480 aa19.86■□□□□ 0.77
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PTGS1-201ENST00000223423 TOP2BQ02880 1626 aa19.84■□□□□ 0.77
PTGS1-201ENST00000223423 TNIKQ9UKE5 1360 aa19.8■□□□□ 0.76
PTGS1-201ENST00000223423 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.79■□□□□ 0.76
PTGS1-201ENST00000223423 CEP162Q5TB80 1403 aa19.77■□□□□ 0.76
PTGS1-201ENST00000223423 GOLGA3Q08378 1498 aa19.77■□□□□ 0.75
PTGS1-201ENST00000223423 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.75■□□□□ 0.75
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PTGS1-201ENST00000223423 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.71■□□□□ 0.75
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PTGS1-201ENST00000223423 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa19.65■□□□□ 0.74
PTGS1-201ENST00000223423 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa19.64■□□□□ 0.73
PTGS1-201ENST00000223423 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa19.62■□□□□ 0.73
PTGS1-201ENST00000223423 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.58■□□□□ 0.72
PTGS1-201ENST00000223423 PRXQ9BXM0 1461 aa19.53■□□□□ 0.72
PTGS1-201ENST00000223423 KIF27Q86VH2 1401 aa19.52■□□□□ 0.72
PTGS1-201ENST00000223423 ERCC6Q03468 1493 aa19.52■□□□□ 0.72
PTGS1-201ENST00000223423 CLIP1P30622 1438 aa19.5■□□□□ 0.71
PTGS1-201ENST00000223423 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.49■□□□□ 0.71
PTGS1-201ENST00000223423 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.48■□□□□ 0.71
PTGS1-201ENST00000223423 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.45■□□□□ 0.7
PTGS1-201ENST00000223423 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP19.42■□□□□ 0.7
PTGS1-201ENST00000223423 CUX2O14529 1486 aa19.42■□□□□ 0.7
PTGS1-201ENST00000223423 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
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PTGS1-201ENST00000223423 VPS8Q8N3P4 1428 aa19.38■□□□□ 0.69
PTGS1-201ENST00000223423 IGF1RP08069 1367 aa19.36■□□□□ 0.69
PTGS1-201ENST00000223423 DNMBPQ6XZF7 1577 aa19.36■□□□□ 0.69
PTGS1-201ENST00000223423 TOPBP1Q92547 1522 aa19.34■□□□□ 0.69
PTGS1-201ENST00000223423 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
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PTGS1-201ENST00000223423 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
PTGS1-201ENST00000223423 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.29■□□□□ 0.68
PTGS1-201ENST00000223423 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
PTGS1-201ENST00000223423 ARAP1Q96P48 1450 aa19.27■□□□□ 0.68
PTGS1-201ENST00000223423 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.26■□□□□ 0.67
PTGS1-201ENST00000223423 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.25■□□□□ 0.67
PTGS1-201ENST00000223423 WDR62O43379 1518 aa19.22■□□□□ 0.67
PTGS1-201ENST00000223423 APLP2Q06481 763 aa19.19■□□□□ 0.66
PTGS1-201ENST00000223423 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa19.18■□□□□ 0.66
PTGS1-201ENST00000223423 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
PTGS1-201ENST00000223423 WDR97A6NE52 1622 aa19.11■□□□□ 0.65
PTGS1-201ENST00000223423 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
PTGS1-201ENST00000223423 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
PTGS1-201ENST00000223423 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
PTGS1-201ENST00000223423 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
PTGS1-201ENST00000223423 CUL7Q14999 1698 aa19.06■□□□□ 0.64
PTGS1-201ENST00000223423 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.05■□□□□ 0.64
PTGS1-201ENST00000223423 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
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