Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 HDHD2-207ENST00000588940 546 ntTSL 418.2■□□□□ 0.54e-6■■■■□ 24
TARDBPQ13148 HDHD2-203ENST00000587388 566 ntTSL 317.5■□□□□ 0.394e-6■■■■□ 24
TARDBPQ13148 HDHD2-208ENST00000590481 569 ntTSL 417.5■□□□□ 0.394e-6■■■■□ 24
TARDBPQ13148 HDHD2-213ENST00000592591 559 ntTSL 416.75■□□□□ 0.274e-6■■■■□ 24
TARDBPQ13148 HDHD2-211ENST00000591480 569 ntTSL 416.75■□□□□ 0.274e-6■■■■□ 24
TARDBPQ13148 HDHD2-205ENST00000588183 2224 ntTSL 1 (best)15.67■□□□□ 0.14e-6■■■■□ 24
TARDBPQ13148 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.094e-6■■■■□ 24
TARDBPQ13148 HDHD2-204ENST00000587841 788 ntTSL 315.36■□□□□ 0.054e-6■■■■□ 24
TARDBPQ13148 HDHD2-202ENST00000586546 568 ntTSL 415.36■□□□□ 0.054e-6■■■■□ 24
TARDBPQ13148 AC012254.2-201ENST00000602459 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.1□□□□□ -0.154e-6■■■■□ 24
TARDBPQ13148 HDHD2-209ENST00000590815 809 ntTSL 312.2□□□□□ -0.464e-6■■■■□ 24
TARDBPQ13148 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.334e-6■■■■□ 24
TARDBPQ13148 AC012254.2-202ENST00000602926 291 ntAPPRIS ALT2 TSL 25.97□□□□□ -1.454e-6■■■■□ 24
TARDBPQ13148 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.235e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 BAMBI-202ENST00000497699 1884 ntTSL 220.21■□□□□ 0.835e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.592e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.552e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 NTRK1-205ENST00000497019 2508 ntTSL 217.44■□□□□ 0.382e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.352e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.232e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 NTRK1-207ENST00000530298 3052 ntTSL 214.15□□□□□ -0.142e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 COQ8A-209ENST00000489044 941 ntTSL 318.49■□□□□ 0.555e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 ABCB6-205ENST00000448398 882 ntTSL 518.02■□□□□ 0.485e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 ABCB6-203ENST00000417678 793 ntTSL 517.45■□□□□ 0.385e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 ATG9A-215ENST00000446716 5245 ntTSL 217.33■□□□□ 0.365e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.285e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 ABCB6-202ENST00000295750 2238 ntTSL 516.46■□□□□ 0.235e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 ABCB6-210ENST00000492953 570 ntTSL 416.27■□□□□ 0.25e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.035e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.015e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.025e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 HK1-205ENST00000436817 1042 ntTSL 514.77□□□□□ -0.055e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.095e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.095e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 PITPNM2-204ENST00000451868 1639 ntTSL 1 (best)14.48□□□□□ -0.095e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.115e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.135e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.135e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.195e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.235e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.245e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 AP001347.1-203ENST00000448463 780 ntTSL 212.92□□□□□ -0.345e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 PITPNM2-206ENST00000541244 663 ntTSL 312.67□□□□□ -0.385e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.455e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.475e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 ABCB6-211ENST00000494639 552 ntTSL 212.1□□□□□ -0.475e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.55e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 PITPNM2-205ENST00000535289 539 ntTSL 211.72□□□□□ -0.535e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 HK1-217ENST00000494253 2848 ntTSL 211.5□□□□□ -0.575e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 ABCB6-213ENST00000497882 3008 ntTSL 210.69□□□□□ -0.75e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 GATAD2A-205ENST00000418032 3480 ntTSL 210.67□□□□□ -0.75e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 HK1-212ENST00000480047 575 ntTSL 1 (best)10.03□□□□□ -0.85e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 ABCB6-212ENST00000496984 707 ntTSL 49.9□□□□□ -0.825e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 SMG1-208ENST00000563448 2016 ntTSL 29.49□□□□□ -0.895e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 PPIL2-204ENST00000417788 4213 ntTSL 29.47□□□□□ -0.895e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 PPIL2-203ENST00000406385 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.915e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 FKBP5-204ENST00000542713 7384 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.985e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 PITPNM2-207ENST00000542210 564 ntTSL 48.89□□□□□ -0.995e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 AP001347.1-201ENST00000428809 1332 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.15e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 AP001347.1-202ENST00000432621 1084 ntTSL 1 (best)7.9□□□□□ -1.145e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 PPIL2-208ENST00000484439 863 ntTSL 57.7□□□□□ -1.185e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 HK1-213ENST00000483054 592 ntTSL 37.46□□□□□ -1.225e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 HK1-204ENST00000421088 707 ntTSL 57.44□□□□□ -1.225e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.385e-7■■■■□ 24
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TARDBPQ13148 SRBD1-203ENST00000475073 567 ntTSL 46.13□□□□□ -1.435e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.475e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 HK1-216ENST00000493591 916 ntTSL 55.61□□□□□ -1.515e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 HK1-214ENST00000483077 750 ntTSL 35.38□□□□□ -1.555e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 HK1-210ENST00000476368 605 ntTSL 35.28□□□□□ -1.565e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 HK1-208ENST00000464803 450 ntTSL 1 (best)5.28□□□□□ -1.565e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 HK1-207ENST00000450646 739 ntTSL 54.71□□□□□ -1.665e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 PPIL2-206ENST00000458567 557 ntTSL 44.62□□□□□ -1.675e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 RIC1-207ENST00000545641 3998 ntTSL 1 (best)4□□□□□ -1.775e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 RIC1-202ENST00000276898 3973 ntTSL 53.55□□□□□ -1.845e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.885e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.353e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.392e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.212e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 ANTXR2-205ENST00000449651 2026 ntTSL 27.09□□□□□ -1.272e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 PTK2-217ENST00000519899 762 ntTSL 26.13□□□□□ -1.433e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 PTK2-229ENST00000521172 507 ntTSL 56.13□□□□□ -1.433e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 PTK2-211ENST00000519361 553 ntTSL 56.13□□□□□ -1.433e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 PTK2-250ENST00000523746 574 ntTSL 46.05□□□□□ -1.443e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 PTK2-247ENST00000523670 542 ntTSL 45.68□□□□□ -1.53e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.523e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 PTK2-210ENST00000519024 576 ntTSL 44.29□□□□□ -1.723e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 PTK2-224ENST00000520843 438 ntTSL 53.26□□□□□ -1.893e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 PTK2-245ENST00000523474 567 ntTSL 52.63□□□□□ -1.993e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 CTSH-202ENST00000525807 1122 ntTSL 519.04■□□□□ 0.642e-6■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.452e-6■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 CTSH-213ENST00000533777 2101 ntTSL 1 (best)16.58■□□□□ 0.242e-6■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.272e-6■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 CTSH-217ENST00000534533 836 ntTSL 310.55□□□□□ -0.722e-6■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 PAPD7-206ENST00000515721 603 ntTSL 328.45■■■□□ 2.142e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.692e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.552e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.322e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.222e-7■■■■□ 23.9
TARDBPQ13148 BICRA-202ENST00000594866 532 ntAPPRIS ALT2 TSL 222.39■■□□□ 1.172e-7■■■■□ 23.9
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