Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NHLH2Q02577 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms