Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD1P98174 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD1P98174 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD1P98174 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD1P98174 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD1P98174 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD1P98174 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD1P98174 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD1P98174 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD1P98174 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD1P98174 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD1P98174 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD1P98174 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD1P98174 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD1P98174 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD1P98174 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD1P98174 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD1P98174 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD1P98174 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD1P98174 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD1P98174 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD1P98174 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGD1P98174 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGD1P98174 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGD1P98174 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGD1P98174 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGD1P98174 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGD1P98174 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGD1P98174 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGD1P98174 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGD1P98174 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGD1P98174 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGD1P98174 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGD1P98174 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGD1P98174 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FGD1P98174 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGD1P98174 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGD1P98174 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGD1P98174 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGD1P98174 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGD1P98174 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGD1P98174 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGD1P98174 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FGD1P98174 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FGD1P98174 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGD1P98174 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGD1P98174 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGD1P98174 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGD1P98174 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGD1P98174 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGD1P98174 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGD1P98174 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGD1P98174 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGD1P98174 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGD1P98174 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FGD1P98174 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGD1P98174 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGD1P98174 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGD1P98174 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGD1P98174 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGD1P98174 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGD1P98174 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGD1P98174 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGD1P98174 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGD1P98174 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGD1P98174 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGD1P98174 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGD1P98174 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGD1P98174 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGD1P98174 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGD1P98174 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGD1P98174 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGD1P98174 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGD1P98174 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGD1P98174 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGD1P98174 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGD1P98174 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FGD1P98174 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD1P98174 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD1P98174 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD1P98174 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD1P98174 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD1P98174 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD1P98174 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD1P98174 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD1P98174 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD1P98174 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD1P98174 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD1P98174 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD1P98174 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD1P98174 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD1P98174 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD1P98174 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD1P98174 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD1P98174 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD1P98174 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD1P98174 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD1P98174 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD1P98174 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FGD1P98174 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms