Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBB4BP68371 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms