Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC12A2P55011 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC12A2P55011 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC12A2P55011 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC12A2P55011 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC12A2P55011 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC12A2P55011 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC12A2P55011 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC12A2P55011 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC12A2P55011 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC12A2P55011 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC12A2P55011 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC12A2P55011 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC12A2P55011 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC12A2P55011 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC12A2P55011 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC12A2P55011 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC12A2P55011 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC12A2P55011 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC12A2P55011 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC12A2P55011 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC12A2P55011 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC12A2P55011 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC12A2P55011 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC12A2P55011 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC12A2P55011 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms