Protein–RNA interactions for Protein: P52198

RND2, Rho-related GTP-binding protein RhoN, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND2P52198 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND2P52198 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND2P52198 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND2P52198 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND2P52198 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND2P52198 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND2P52198 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND2P52198 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RND2P52198 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND2P52198 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND2P52198 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND2P52198 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND2P52198 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND2P52198 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND2P52198 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND2P52198 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND2P52198 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND2P52198 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND2P52198 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND2P52198 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND2P52198 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND2P52198 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND2P52198 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RND2P52198 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND2P52198 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND2P52198 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND2P52198 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND2P52198 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND2P52198 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND2P52198 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND2P52198 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RND2P52198 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND2P52198 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RND2P52198 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND2P52198 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND2P52198 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RND2P52198 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND2P52198 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND2P52198 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND2P52198 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND2P52198 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND2P52198 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND2P52198 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND2P52198 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND2P52198 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND2P52198 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND2P52198 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RND2P52198 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND2P52198 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND2P52198 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND2P52198 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND2P52198 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND2P52198 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND2P52198 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RND2P52198 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RND2P52198 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RND2P52198 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RND2P52198 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RND2P52198 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RND2P52198 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RND2P52198 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RND2P52198 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RND2P52198 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RND2P52198 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RND2P52198 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RND2P52198 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RND2P52198 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RND2P52198 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RND2P52198 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RND2P52198 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RND2P52198 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RND2P52198 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RND2P52198 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RND2P52198 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RND2P52198 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RND2P52198 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RND2P52198 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RND2P52198 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RND2P52198 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RND2P52198 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RND2P52198 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RND2P52198 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RND2P52198 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND2P52198 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND2P52198 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND2P52198 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND2P52198 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND2P52198 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND2P52198 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND2P52198 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND2P52198 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND2P52198 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND2P52198 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND2P52198 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND2P52198 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND2P52198 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RND2P52198 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND2P52198 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND2P52198 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RND2P52198 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms