Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM4P49221 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM4P49221 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM4P49221 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM4P49221 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM4P49221 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM4P49221 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM4P49221 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM4P49221 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM4P49221 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM4P49221 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM4P49221 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM4P49221 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM4P49221 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM4P49221 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM4P49221 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM4P49221 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TGM4P49221 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM4P49221 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM4P49221 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM4P49221 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM4P49221 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM4P49221 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM4P49221 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM4P49221 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM4P49221 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM4P49221 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM4P49221 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM4P49221 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM4P49221 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM4P49221 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM4P49221 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM4P49221 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM4P49221 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM4P49221 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM4P49221 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM4P49221 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM4P49221 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM4P49221 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM4P49221 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TGM4P49221 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TGM4P49221 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM4P49221 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM4P49221 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM4P49221 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM4P49221 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM4P49221 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM4P49221 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM4P49221 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM4P49221 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM4P49221 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM4P49221 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM4P49221 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM4P49221 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM4P49221 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM4P49221 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM4P49221 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM4P49221 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM4P49221 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM4P49221 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM4P49221 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TGM4P49221 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM4P49221 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM4P49221 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM4P49221 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM4P49221 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM4P49221 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM4P49221 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM4P49221 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM4P49221 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM4P49221 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM4P49221 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM4P49221 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM4P49221 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM4P49221 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM4P49221 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM4P49221 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM4P49221 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM4P49221 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM4P49221 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM4P49221 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM4P49221 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM4P49221 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TGM4P49221 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM4P49221 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM4P49221 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM4P49221 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM4P49221 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM4P49221 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM4P49221 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM4P49221 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM4P49221 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM4P49221 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM4P49221 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM4P49221 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM4P49221 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM4P49221 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM4P49221 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM4P49221 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TGM4P49221 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms