Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMB9P28065 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMB9P28065 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms