Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LYL1P12980 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYL1P12980 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYL1P12980 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYL1P12980 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYL1P12980 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYL1P12980 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYL1P12980 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYL1P12980 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYL1P12980 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LYL1P12980 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYL1P12980 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYL1P12980 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYL1P12980 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYL1P12980 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYL1P12980 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYL1P12980 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYL1P12980 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYL1P12980 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYL1P12980 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYL1P12980 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LYL1P12980 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LYL1P12980 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LYL1P12980 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LYL1P12980 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LYL1P12980 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LYL1P12980 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LYL1P12980 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LYL1P12980 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LYL1P12980 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LYL1P12980 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LYL1P12980 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LYL1P12980 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LYL1P12980 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LYL1P12980 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LYL1P12980 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LYL1P12980 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LYL1P12980 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYL1P12980 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYL1P12980 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYL1P12980 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYL1P12980 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYL1P12980 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYL1P12980 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYL1P12980 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYL1P12980 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYL1P12980 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYL1P12980 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYL1P12980 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LYL1P12980 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYL1P12980 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYL1P12980 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYL1P12980 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYL1P12980 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYL1P12980 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYL1P12980 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYL1P12980 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYL1P12980 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LYL1P12980 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms