Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPLO60437 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPLO60437 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPLO60437 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPLO60437 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPLO60437 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPLO60437 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPLO60437 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPLO60437 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPLO60437 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PPLO60437 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPLO60437 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPLO60437 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPLO60437 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPLO60437 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPLO60437 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPLO60437 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PPLO60437 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPLO60437 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PPLO60437 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PPLO60437 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPLO60437 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPLO60437 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPLO60437 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPLO60437 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPLO60437 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPLO60437 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPLO60437 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPLO60437 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPLO60437 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPLO60437 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPLO60437 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPLO60437 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPLO60437 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PPLO60437 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPLO60437 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPLO60437 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PPLO60437 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PPLO60437 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPLO60437 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPLO60437 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PPLO60437 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPLO60437 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PPLO60437 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPLO60437 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPLO60437 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPLO60437 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPLO60437 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPLO60437 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPLO60437 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPLO60437 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPLO60437 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPLO60437 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPLO60437 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPLO60437 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PPLO60437 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PPLO60437 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PPLO60437 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPLO60437 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPLO60437 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPLO60437 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPLO60437 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPLO60437 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPLO60437 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPLO60437 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPLO60437 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPLO60437 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPLO60437 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPLO60437 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPLO60437 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPLO60437 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PPLO60437 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPLO60437 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PPLO60437 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PPLO60437 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PPLO60437 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PPLO60437 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PPLO60437 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PPLO60437 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PPLO60437 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PPLO60437 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PPLO60437 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PPLO60437 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PPLO60437 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPLO60437 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PPLO60437 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PPLO60437 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPLO60437 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPLO60437 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPLO60437 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPLO60437 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPLO60437 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPLO60437 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPLO60437 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPLO60437 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPLO60437 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPLO60437 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPLO60437 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPLO60437 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPLO60437 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms