Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms