Protein–RNA interactions for Protein: A8MV81

HIGD1C, HIG1 domain family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1CA8MV81 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIGD1CA8MV81 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms