Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GOLGA6L9A6NEM1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GOLGA6L9A6NEM1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms