Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL2

SSR3, Translocon-associated protein subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR3Q9UNL2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SSR3Q9UNL2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SSR3Q9UNL2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms