Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
XCL2Q9UBD3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.08■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.07■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.07■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.06■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.06■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.06■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
XCL2Q9UBD3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.05■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.05■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XCL2Q9UBD3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms