Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC88CQ9P219 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC88CQ9P219 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC88CQ9P219 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC88CQ9P219 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC88CQ9P219 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC88CQ9P219 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC88CQ9P219 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC88CQ9P219 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC88CQ9P219 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC88CQ9P219 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC88CQ9P219 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC88CQ9P219 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC88CQ9P219 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC88CQ9P219 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC88CQ9P219 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC88CQ9P219 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC88CQ9P219 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC88CQ9P219 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC88CQ9P219 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC88CQ9P219 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC88CQ9P219 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC88CQ9P219 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC88CQ9P219 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC88CQ9P219 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms