Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDKN2AIPQ9NXV6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDKN2AIPQ9NXV6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms