Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COMMD8Q9NX08 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.31■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COMMD8Q9NX08 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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