Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GFRA4Q9GZZ7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GFRA4Q9GZZ7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms