Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PKNOX2Q96KN3 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PKNOX2Q96KN3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms