Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LRIG1Q96JA1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRIG1Q96JA1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms