Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms