Protein–RNA interactions for Protein: Q66K80

RUSC1-AS1, Putative uncharacterized protein RUSC1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1-AS1Q66K80 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1-AS1Q66K80 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1-AS1Q66K80 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1-AS1Q66K80 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1-AS1Q66K80 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1-AS1Q66K80 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1-AS1Q66K80 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1-AS1Q66K80 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1-AS1Q66K80 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1-AS1Q66K80 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1-AS1Q66K80 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1-AS1Q66K80 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1-AS1Q66K80 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1-AS1Q66K80 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1-AS1Q66K80 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1-AS1Q66K80 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUSC1-AS1Q66K80 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUSC1-AS1Q66K80 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms