Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLX4IPQ5VYV7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLX4IPQ5VYV7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms