Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
MYOM3Q5VTT5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC31.12■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
MYOM3Q5VTT5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms