Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RSPH4AQ5TD94 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RSPH4AQ5TD94 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms